Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA3Q96EY1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms