Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
L3HYPDHQ96EM0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms