Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELP4Q96EB1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms