Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NXNL1Q96CM4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms