Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 29.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 C4orf36-204ENST00000503001 708 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ADD1-212ENST00000508277 491 ntTSL 59.51□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.48□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 39.46□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TOP3A-211ENST00000581536 766 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-204ENST00000471353 697 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-211ENST00000487627 626 ntTSL 49.37□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTM1-205ENST00000490530 806 ntTSL 39.06□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 48.97□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDE1-207ENST00000573203 762 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GTF3C1-210ENST00000569394 566 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PPM1H-204ENST00000551214 862 ntTSL 38.72□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 QKI-209ENST00000537124 551 ntTSL 58.7□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 58.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 B3GALNT2-207ENST00000612859 2920 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-206ENST00000462444 793 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PRELID2-206ENST00000510594 552 ntTSL 38.62□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.041e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 48.54□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 48.52□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MDC1-204ENST00000422266 583 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TAF1A-201ENST00000350027 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-226ENST00000523239 519 ntTSL 58.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-213ENST00000493474 590 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SIAH1-204ENST00000563745 589 ntTSL 48.34□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AVL9-203ENST00000446718 6372 ntTSL 58.28□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLRX5-202ENST00000553672 912 ntTSL 28.21□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ONECUT1-203ENST00000561401 583 ntTSL 38.12□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-206ENST00000439627 1819 ntTSL 38.1□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GTF2E2-204ENST00000522833 752 ntTSL 38.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GLUL-209ENST00000480604 908 ntTSL 57.94□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-207ENST00000480110 4547 ntTSL 27.9□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 POLG-207ENST00000528881 524 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 APBB2-227ENST00000513611 2964 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 37.65□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-209ENST00000494924 2338 ntTSL 27.62□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 27.6□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-217ENST00000521866 1807 ntTSL 57.58□□□□□ -1.24e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-204ENST00000473213 595 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-205ENST00000518809 4116 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.224e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-208ENST00000555499 527 ntTSL 57.33□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC33A1-203ENST00000460729 499 ntTSL 37.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 36.97□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DAAM1-209ENST00000556596 2844 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-211ENST00000491018 817 ntTSL 36.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DUSP22-203ENST00000603005 352 ntTSL 36.87□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 56.79□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NFX1-202ENST00000379521 3609 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 UBXN4-205ENST00000467065 334 ntTSL 56.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-208ENST00000482451 626 ntTSL 56.6□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KMT2C-204ENST00000418061 710 ntTSL 56.52□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LUC7L-212ENST00000443357 833 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-209ENST00000431571 1833 ntTSL 26.46□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-213ENST00000521154 560 ntTSL 26.45□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DRG2-211ENST00000578767 577 ntTSL 46.42□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-220ENST00000522544 372 ntTSL 56.42□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PRKRA-212ENST00000490501 1851 ntTSL 26.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 31.4
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 300.3 ms