Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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