Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms