Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS4Y2Q8TD47 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RPS4Y2Q8TD47 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPS4Y2Q8TD47 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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