Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BHLHE23Q8NDY6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms