Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B5

JMY, Junction-mediating and -regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMYQ8N9B5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMYQ8N9B5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms