Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms