Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTBP4Q8N2S1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTBP4Q8N2S1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms