Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKL3Q8IVW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKL3Q8IVW4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms