Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms