Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms