Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAR1Q7Z6K3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAR1Q7Z6K3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms