Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms