Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00114Q6XXX2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms