Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms