Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REEP3Q6NUK4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms