Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms