Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GARNL3Q5VVW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms