Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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