Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms