Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCID2Q5JVF3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms