Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms