Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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