Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms