Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9B1Q4ZJI4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms