Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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