Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RRN3P1Q2M238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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