Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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