Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms