Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RTN1Q16799 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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