Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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