Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CST6Q15828 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CST6Q15828 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CST6Q15828 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CST6Q15828 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CST6Q15828 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CST6Q15828 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CST6Q15828 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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