Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ALX1Q15699 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ALX1Q15699 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ALX1Q15699 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ALX1Q15699 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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