Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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