Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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