Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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