Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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