Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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