Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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