Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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