Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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