Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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