Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTP4A2Q12974 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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