Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF2Q12933 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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