Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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