Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms